月经后第二天同房怀孕的概率较低，但并非完全不可能。这主要取决于月经周期的长短以及排卵是否提前。对于周期规律的女性，月经刚结束时通常处于安全期，怀孕可能性很小。但对于月经周期较短或排卵不规律的女性，精子在体内存活时间较长，仍存在怀孕风险。
大多数情况下，月经后第二天属于安全期，怀孕概率较低。女性的排卵期通常在下次月经来潮前的14天左右，而月经刚结束时，卵泡尚处于发育早期，还未成熟排出。此时子宫内膜也处于增殖期初期，不利于受精卵着床。因此，对于月经周期规律，例如28-30天来一次月经的女性，月经干净后第二天同房，距离排卵日还有较长时间，精子在女性生殖道内通常只能存活2-3天，很难等到卵子排出，所以怀孕的可能性很小。这种情况下，女性无需过度焦虑，可以观察月经情况，若担心可采取基础体温监测或排卵试纸辅助判断。
少数情况下，月经后第二天同房仍可能怀孕。这主要发生在月经周期较短的女性身上，例如周期只有21-23天。这类女性的排卵期会相应提前，可能在月经干净后几天就发生排卵。如果月经持续时间较长，例如经期有7天，那么月经后第二天实际上已经接近排卵期。此外，部分女性存在排卵不规律或额外排卵的情况，加上精子在体内有时可存活长达5天，若恰巧遇到提前排卵，就有受孕的可能。因此，对于月经周期不规律或周期偏短的女性，月经后第二天并非绝对安全，建议采取避孕措施。如果出现月经推迟，应及时进行早孕检测或就医检查。
为了身体健康和避免意外怀孕，建议女性了解并记录自己的月经周期，计算排卵期。如果没有生育计划，即使在安全期同房，也建议使用避孕套等可靠的避孕方法。同时，注意保持会阴部清洁卫生，避免不洁性行为，预防生殖道感染。如果出现月经推迟超过7天，或伴有腹痛、恶心等早孕反应，应及时到妇科就诊，通过血HCG或B超检查确认是否怀孕。