13岁少女服用避孕药可能干扰内分泌系统发育，增加血栓风险，并影响骨骼健康。紧急避孕药可能导致月经紊乱，长期避孕药可能抑制身高增长。青春期女性生殖系统尚未成熟，药物代谢能力较弱，非必要情况下不建议使用。
避孕药含合成雌激素和孕激素，会打破下丘脑-垂体-卵巢轴的平衡。青春期少女激素水平本就不稳定，服药后出现乳房胀痛、情绪波动的概率较高。部分人群可能持续3-6个月月经周期异常，如经量减少或点滴出血。临床常见黄体酮胶囊、炔雌醇环丙孕酮片等药物成分可能加重这种情况。
雌激素会促进凝血因子合成，13岁人群服药后深静脉血栓概率是成年女性的2-3倍。肥胖或家族有血栓病史者风险更高，可能出现下肢肿痛、突发呼吸困难。屈螺酮炔雌醇片等第四代避孕药相对安全，但青春期仍须谨慎。
长期服用避孕药可能影响生长激素分泌，骨骺闭合提前导致最终身高降低。研究表明连续用药1年以上者，骨密度增长速度比同龄人慢。左炔诺孕酮片等药物说明书明确提示青春期女性需评估生长发育情况。
避孕药可能引起糖耐量受损，增加未来糖尿病风险。部分少女服药后出现体重增加、水钠潴留，与去氧孕烯炔雌醇片等药物对醛固酮系统的影响有关。肝功能未发育完全者药物代谢缓慢，更易发生不良反应。
青春期子宫内膜处于敏感期，紧急避孕药可能引发异常子宫出血。重复使用米非司酮片等药物会导致月经周期紊乱，严重者可能影响未来生育功能。临床建议每年使用紧急避孕药不超过2次。
青春期女性应优先采用避孕套等物理避孕方式，若必须使用药物需在妇科医生指导下进行。日常注意记录月经周期变化，出现严重头痛、视物模糊等症状立即就医。保持均衡饮食补充维生素D和钙质，适量运动有助于维持骨骼健康。家长需加强性教育指导，帮助孩子建立正确的避孕观念。