支原体持续阳性可能与反复感染、治疗不彻底、免疫力低下、耐药性产生或检测误差有关，需针对性用药、增强免疫和规范复查。
支原体可通过性接触或密切接触传播，伴侣未同步治疗易导致交叉感染。治疗需双方同时进行，推荐使用阿奇霉素、多西环素或莫西沙星等抗生素，疗程结束后4周复查。
擅自停药或疗程不足会使支原体未被完全清除。规范用药应完成7-14天全疗程，克拉霉素、左氧氟沙星等药物需按剂量服用，避免漏服。治疗期间禁止饮酒。
HIV感染者、糖尿病患者等群体因免疫缺陷更易出现持续感染。除抗生素治疗外，建议补充维生素C、锌制剂，保持每周3次有氧运动如快走、游泳以提升免疫力。
部分地区支原体对红霉素类耐药率达60%，需通过药敏试验调整用药。新型抗生素如吉米沙星、普托霉素可能对耐药菌株有效，需在医生指导下使用。
PCR检测可能出现假阳性，尤其治愈后死亡病原体残留。建议间隔1个月复查，采用培养法结合核酸检测确认。治疗期间避免阴道灌洗等干扰检测的行为。
支原体阳性期间应避免辛辣刺激食物，多摄入酸奶、西兰花等富含益生菌和抗氧化物质的食物。每日清洗外阴并更换纯棉内裤，治疗期间使用避孕套防止重复感染。长期未转阴需排查盆腔炎、输卵管阻塞等并发症，备孕女性建议进行输卵管造影检查。适当进行瑜伽、盆底肌训练有助于改善生殖系统血液循环。