功能性障碍与器质性障碍的核心区别在于病因是否伴随器官结构异常，功能性多由心理或生理调节异常引起，器质性则存在明确组织损伤。
功能性障碍通常无器质性病变基础，如心理性勃起功能障碍因焦虑或压力导致神经调节异常；器质性障碍存在解剖结构改变，如动脉硬化引起的血管性勃起功能障碍。诊断需通过超声、激素检测等手段确认是否存在组织损伤。
功能性症状往往具有波动性，如心因性早泄在特定情境下发作；器质性症状呈持续性，如糖尿病神经病变导致的射精障碍。夜间勃起测试可辅助鉴别，功能性障碍者通常保留正常夜间勃起功能。
功能性治疗侧重行为干预，如性感集中训练改善性焦虑；器质性需针对原发病治疗，如前列腺炎引发的疼痛需抗生素治疗。药物治疗中，功能性可用SSRI类调节神经递质，器质性常用PDE5抑制剂改善血流。
功能性评估多采用心理量表如IIEF-5；器质性诊断依赖客观检查，如阴茎血流多普勒超声检测动脉供血情况。激素六项检测可排除内分泌因素导致的器质病变。
功能性障碍通过认知行为治疗有效率可达70%以上；器质性障碍预后取决于原发病控制，如严重血管病变需血管重建手术。混合型障碍需心理和药物联合干预。
日常调理建议：增加富含精氨酸食物如核桃、海参改善血管功能，进行凯格尔运动增强盆底肌控制力。器质性疾病患者需控制血压血糖等基础指标，功能性障碍者可通过冥想减轻压力。出现持续症状超过3个月需进行泌尿生殖系统专科检查，排除肿瘤、神经病变等器质性疾病。