女性菌群失调需根据具体病因选择药物，常见治疗包括抗生素、益生菌制剂、局部抗真菌药物、雌激素调节剂和中药调理。
细菌性阴道病常需甲硝唑口服或阴道凝胶、克林霉素乳膏或口服、替硝唑等抗生素。用药期间需避免饮酒，完成全程治疗防止复发。反复发作需进行药物敏感试验。
乳酸杆菌制剂如定君生、延华胶囊可直接补充阴道有益菌，调节pH值。口服益生菌培菲康、丽珠肠乐通过肠道调节间接改善菌群，需连续使用2-3个月。
念珠菌感染适用克霉唑栓剂、制霉菌素泡腾片、氟康唑口服。混合感染需联用抗真菌药与抗生素，月经后重复1疗程预防复发。
绝经后患者可使用雌三醇软膏局部给药，改善阴道黏膜环境。口服雌激素替代需评估乳腺和子宫内膜风险，配合孕激素使用。
妇炎康片、妇科千金片等中成药可清热利湿，配合苦参凝胶局部使用。脾虚型可服用参苓白术丸，肾虚型适用六味地黄丸。
日常避免过度冲洗阴道，选择棉质透气内裤。饮食增加酸奶、大豆异黄酮和维生素C摄入，减少高糖食物。每周3次凯格尔运动改善盆底血液循环，游泳和瑜伽有助于调节内分泌。出现异常分泌物持续3天以上或伴随瘙痒灼痛，需及时进行白带常规和细菌培养检查。长期使用抗生素或免疫抑制剂者应定期监测阴道微生态。