安全套能降低多数性传播疾病风险，但无法完全阻断所有病原体，防护效果与病毒传播途径、使用方法、材质质量等因素相关。
乳胶安全套通过物理屏障阻隔精液和阴道分泌物，对HIV、淋病、衣原体等通过体液传播的疾病防护率达85%以上。但病毒颗粒可能透过材质微孔，如乙肝病毒直径42纳米，小于天然乳胶孔隙约5000纳米，存在理论穿透风险。正确使用需全程佩戴，避免中途滑脱或破裂。
皮肤接触传播的疾病如HPV人类乳头瘤病毒、生殖器疱疹和梅毒，安全套无法覆盖所有病变区域。HPV可通过外阴、肛周等未防护皮肤接触感染，研究显示安全套仅降低60%HPV感染风险。尖锐湿疣患者即使使用安全套，病灶区直接接触仍可能导致传播。
阴虱、疥螨等寄生虫可通过毛发或皮肤接触传播，安全套无法防护。公共浴巾、床单等间接接触也可能传播此类疾病。滴虫性阴道炎虽主要经性行为传播，但共用浴具或泳池也可能感染，需配合个人卫生管理。
实际防护效果受多重因素影响：油性润滑剂会腐蚀乳胶材质增加破裂率；过期安全套弹性下降易出现渗漏；尺寸不当可能导致脱落。建议选择聚氨酯材质孔隙仅200纳米应对微小病毒，配合水基润滑剂提升安全性。
单一措施无法实现100%防护，建议结合定期筛查如HIV/梅毒检测、疫苗接种HPV疫苗、乙肝疫苗、暴露前预防PrEP等多重手段。伴侣双方保持健康状态沟通，避免高危性行为更为关键。
日常需注意生殖器清洁，性行为后及时排尿冲洗可能降低尿路感染风险。饮食上摄入富含维生素C的柑橘类水果和锌元素丰富的牡蛎，有助于增强黏膜免疫力。规律运动如快走或瑜伽可改善盆腔血液循环，但防护核心仍在于正确使用安全套并建立全面的疾病预防体系。