多数性传播疾病的症状表现在生殖器上，如梅毒、淋病、尖锐湿疣等，病症表现在生殖器上。但是，也有性传染病，生殖器以外的器官全身发生，如艾滋病等容易引起误诊、误治。
淋菌性口腔、咽喉疾病
主要由口交引起。淋菌性口腔疾病的常见症状是口腔硬腭上出现赘肉，表面不平整，呈菜花状突出的喉咙疾病的常见症状是喉咙红肿，扁桃体增大，按上感治疗几乎没有效果。
淋菌性眼病
性传播疾病之一种，有成人型、儿童型及婴儿型三种。成人型多为患者自己用手揉眼睛时感染，儿童型多为父母或保姆感染，婴儿型多为出生时出生的。莆田墟状主要表现为眼睑红肿、结膜充血、眼球表面形成片状假膜。一开始可以看到红色的水样或血样分泌物，红肿减轻后，眼睑裂开会流出脓性分泌物，分泌物中有大量的淋球菌。
直肠综合征
性传播疾病之一种，是一组以排便痛、痒、大便呈黏液为主要症状的疾病，多发于同性恋有直肠性交史者，少数患者是生殖道感染淋菌后传播到直肠部位，病原体多为淋病双球菌、梅毒螺旋体、沙眼衣原体、单纯疱疹病毒等。
淋浴性关节炎
淋浴性关节炎患者中的40%-60%是淋浴双球菌感染引起的。此病具有受累关节不对称、多关节发病、发病前皮肤上有红斑脓疱或手脚腱鞘炎等特点。80%的患者可从其宫颈、直肠、尿道或咽部培养出淋球菌。
性传播疾病性肝周炎
这种疾病是性传播疾病病原体经血液播散至肝脏所致，部分病人表现为心肌心包炎、肺炎等。
常见症状为右上腹剧烈疼痛、压痛及反跳痛，并伴有发烧、下腹痛等盆腔炎症状，但无肝脏肿大、无黄疸的急腹症。其病原体为淋病双球菌、沙眼衣原体或支原体等。