男性性功能障碍的内分泌治疗主要是指睾酮和绒毛膜促性素的应用。早在本世纪初，睾酮就被命名为返老还童的药物"男性荷尔蒙"，有"强身"工作。今天，这种理解早已得到纠正。睾酮的作用已在生殖器官的组成和功能部分中描述，这里不再重复。
它仍然广泛应用于治疗男性性功能障碍。理论上，该药物对男性雄激素缺乏的性功能障碍患者应有效，许多患者也反映了其主观疗效。然而，一些学者认为，对于非雄激素缺乏的患者，该药物只起精神治疗的作用，短期内可能有效。这涉及到病例的选择。
鉴于这类患者性内分泌潜力低下(即性内分泌储备功能受损)相当普遍，其实这种药的适应范围比预期的要广，所有疑似性内分泌不足的患者都可以试用，但不宜长期使用，一般为1~2周即可。根本办法是恢复睾丸间质细胞或腺垂体促性腺激素的功能，否则药物的作用毕竟是暂时的。
应该指出:目前滥用男性激素的现象比较普遍，在基层尤为严重，主要表现在长期连续使用。必须认识到长期滥用睾酮会造成严重的损害。睾酮水平高，使腺垂体促性腺激素分泌减少，可导致睾丸萎缩。大量实验资料证明，丙酸睾酮每天注射25毫克，连续注射25毫克~精子缺乏症可在3个月内发生；大量服用睾酮可增加玫瑰红细胞总数、钠和水潴留；此外，睾酮可使血清发生β-脂蛋白增加，α-脂蛋白减少，这种变化可能与动脉粥样硬化有关；在某些情况下，睾酮也会增加血清胆固醇。此外，还有痤疮、多毛、肥胖、心脏和肝功能受损等不良反应。动物试验表明，睾酮过多会导致大鼠高血压。
睾酮的一些新合成衍生物种类繁多，但一般只在男性计划生育范围内试用。苯丙酸诺龙虽然蛋白质合成效果强，但对性功能的影响较差，能障碍。
临床上不能使用腺垂体促性腺激素。但胎盘绒促性素对睾丸的刺激作用与腺垂体促性腺激素相似。该激素早已纯化，来源广泛，已用于临床实践，可对男性性功能障碍、隐睾、无睾等生殖系统疾病、妇科功能性出血等疾病获得一定疗效。