性功能障碍是指男性和女性在性欲状态和性唤起能力、男性阴茎勃起状态、女性阴道对勃起阴茎的容、男性阴茎在性交过程中能否保持满意的勃起时间、女性是否有性高潮、男性射精能力等功能障碍。
一、功能性功能障碍系统、神经系统、内分泌系统无器质性病理变化。性功能障碍的原因是性相关系统和环节功能障碍。如：大脑皮质功能障碍、内分泌功能障碍、失衡等。用简单的比喻"电脑"并没有"硬件损坏"，"死机或运行不畅"是"操作系统"或"某些软件"有问题。在学科划分上，功能障碍属于心理学研究范畴，功能障碍是心理行为主义学派的一个分支。
二、器质性功能障碍:性功能障碍是由生殖系统、神经系统和内分泌系统引起的器质性病变。也就是说"电脑"的"硬件"有损坏，要做"硬件"修复甚至更换。修复人类"硬件"很难治疗器质性功能障碍。器质性功能障碍属于临床医学范畴，需要到正规医院专科检查治疗。