生殖系统感染是不孕不育的重要根源，也是女性手淫的苦果之一。未婚女性的阴道防卫功能还不健全，阴道粘膜脆弱，在异物的刺激下容易发生充血水肿和粘膜损伤，病原菌侵入方便的门。手淫工具不卫生，容易感染。有些女性喜欢用蔬菜手淫，其农药和病原菌严重损伤阴道粘膜，甚至导致农药中毒。
有些女性喜欢用光滑的玻璃制品做手淫工具，结果玻璃破裂嵌入阴道，导致阴道外伤甚至大出血。更多的女性用手指手淫，手指接触各种各样的东西不可避免地会有很多病原菌，特别是指甲缝里藏着垢带菌，后患无穷。上述各种不洁手淫，容易引起阴道炎、子宫颈炎、子宫内膜炎、输卵管炎严重者腹膜炎、败血症等反复炎性破坏，输卵管内膜和肌层创伤如瘢痕形成、粘膜纤毛坏死最终引起输卵管梗阻和蠕动功能障碍，婚后卵子、精子运行和受精卵着床
经常手淫的未婚女性，骨盆血综合征、痛经等疾病的发生率也相当高。手淫引起的心理障碍，也有不育的女性频繁手淫，身体生病，结婚后性生活难以取得理想效果，结果思想负担重，也有性冷淡的女性给生育带来了很多困难。
另外，有些女性对生殖器官的位置不清楚，在手淫活动中尿道误认为阴道也能得到舒适和满足感。据研究，尿道具有一定的吞咽能力，加上女性尿道短直，用短异物作为手淫工具，尿道容易吸入膀胱，怕被别人嘲笑，不暴露真相，不想去医院诊治，急性尿滞和泌尿系统的反复感染和生殖系统感染
前不育少女少女时期经常手淫的她，也许注意清洁卫生没有发生严重的生殖系统感染，但一定会有不适感的长期轻度炎症也会严重影响生殖系统健康发育的危险，直到结婚才暴露出来。
女性婚前手淫是许多女性不可避免的问题，适度的手淫可以缓解性紧张，偶尔不可避免，但要注意卫生，特别是阴道不适时不能禁忌医生。未婚女性最好把主要精力放在学习、工作和有益的兴趣上，学习和正确理解性知识，尽量不要在性问题上手淫，保证婚后有正常的性生活和健康的生育能力。