男性不育的病因分类可根据生育能力分为绝对不育(无精子症)和相对不育(精子数量少或精子活力低等)，按临床表现可分为原发性和继发性不育，按性器官病变部位可分为睾丸前性、睾丸性和睾丸后性。男性不育的原因比较复杂，现就主要原因分述如下:
1
精液异常
(1)无精子或精子过少精液中精子密度低于0.2×10/ml时女方受孕机会减少，造成不育。这种不育可分为永久性和暂时性，前者见于先天性睾丸发育障碍或睾丸、精囊严重病变者;后者多见于性生活过频导致生精功能一度衰竭，一般为精子减少而不是全无精子。
(2)精子质量差精液中无活力的或死精子过多(超过20%)，或精子活动能力很差或畸形精子超过30%，常可造成不育。
(3)精液理化性状异常正常精液射出后很快凝成胶冻状，在以后的15～30分钟内又全部液化。如果精液射出后不凝固，或液化不全常提示精囊或前列腺有病变。细菌、病毒感染生殖道也可造成精液成分的改变以致引起不育。
2
生精障碍
(1)睾丸本身疾病睾丸肿瘤、睾丸结核、睾丸梅毒、睾丸非特异性炎症、外伤或精索扭转后睾丸萎缩、睾丸缺如等，均可造成生精功能障碍，发生不育。
(2)染色体异常性染色体异常可使睾丸等性器官分化不良，造成真性两性畸形和先天性睾丸发育不全等。常染色体异常可导致性腺及生精细胞代谢紊乱。
(3)精子发生功能障碍长期食用棉子油可影响精子发生精子自身免疫，也可造成精子发生功能障碍。
(4)局部病变如隐性精索静脉曲张、巨大鞘膜积液等疾病影响了睾丸局部的外环境，或因温度、压迫等原因造成不育。
3
精子、卵子结合障碍
(1)精道梗阻先天性输精管道的缺如闭锁等畸形，手术结扎输精管，精道及其周围组织的慢性炎症等。
(2)逆行射精膀胱颈部曾做过手术或受到损伤或手术后瘢痕挛缩使尿道畸形变，双侧腰交感神经切除术后或直肠癌腹会阴手术后，糖尿病引起的阴部神经损害，精索囊肿肥大，以及严重尿道狭窄，某些药物可引起支配膀胱的交感神经功能改变。
(3)外生殖器异常如先天性阴茎缺、如阴茎过小、男性假两性畸形、尿道上裂或下裂、后天性阴茎炎症或损伤、阴囊水肿、巨大睾丸鞘膜积液等，例如阳痿就是男性不育的原因之一，因为精子没有办法正常射入阴道内与卵子相遇。
4
全身性因素
(1)精神和环境因素生活环境突然改变导致长期精神紧张，进行高空、高温、超强度劳作以及从事放射线工作。
(2)营养因素严重的营养不良，维生素A、维生素E缺乏症，微量元素如锌、锰缺乏，钙、磷代谢紊乱，汞、砷、铅、乙醇、尼古丁、棉子油等毒性物质慢性中毒，化疗药物治疗等。
(3)内分泌疾病垂体性侏儒症、肥胖、生殖无能综合征、腺垂体功能减退症、先天性性腺不发育症、先天性生精不能综合征、高催乳素症、垂体瘤或颅内感染、产伤等。