附睾炎的发病机理就是多种细菌感染而成的疾病，这类的疾病的治疗需要根治，不然因为病菌的繁殖能力是相当强的，没有根除就一定会反复的发作，用对药物是很重要的，切忌自己盲目认为搽普通药膏就好，目前比较科学的方式还是使用抗生素，假如抗生素等药物没有作用的话，那就需要进行手术来进行帮助治疗，拖得越久病菌越多治疗难度越大。下面详细介绍四种附睾炎治疗方式。
1.一般治疗
卧床休息，应用阴囊托可减轻症状，自制较大的带棉花垫的阴囊托使用起来会更舒适。感到疼痛比较剧烈的患者则应该食用止痛药，然后用局部热疗来缓解症状，这样可以促进炎症消退。但是切忌过早的食用热疗，那样只会带来疼痛剧烈并且还可能促进感染扩散的可能，早起推荐还是利用冰袋来局部冷敷较好。性生活和过度的体力劳动也会加重感染，因此要注意控制。
2.抗菌药物的应用
一般的患者都是先进行药物治疗，例如一些抗生素药物的使用。选择对细菌敏感的药物，通常静脉给药1-2周后，口服抗菌药物2-4周，预防转为慢性炎症。
3.手术治疗
常常有很多患者都是多次治疗初期是有明显的效果，但是后期还是复发了，这也是附睾炎的一个特征之一，复发性极高的疾病。倘若是使用抗生素治疗无效，疑有睾丸缺血市，应行附睾切开减压，纵行或横行多出切开附睾脏层鞘膜，但要避免伤及附睾管。手术治疗也是一个比较特殊的手段了，因为也存在风险性，但是随着科技的提升，手术的风险也在降低着。
4.慢性睾丸炎治疗
慢性附睾炎单纯应用药物效果不一定理想。除应用有效广谱抗生素外，局部热敷等物理治疗也是很有必要的。也可以采用附睾局部应用黄连素或新霉素等离子透入治疗。若有慢性前列腺炎，必须同时进行治疗。反复发作来源于慢性前列腺炎的附睾炎，可考虑结扎输精管后再进行治疗。对于多次反复发作者，也可考虑做附睾切除术。
而对于治疗期间来说，患者则不应该这边吃药治疗，另外一边又放纵自己性行为以及过度体力劳动，这样只会使治疗得不偿失，这会使得病情的反复更加严重，因此克制自己是一件很重要的事情，良好的生活习惯会帮助身体恢复，然而恶习只会加重病情，附睾炎治疗要从认识治疗方式开始。