因前列腺体表面有一层脂质包膜，大多数抗生素很难通过此膜进入前列腺体内发挥治疗作用，因此在选择抗菌药物时应遵循如下原则：
(1)药物对细菌有较高的敏感性。
(2)确定应用的药物应以高脂溶性、高渗透能力、与血浆蛋白结合率低、离解度高的药物为其标准。
(3)两种以上并有增效作用的药物联合使用。
(4)为使药物在前列腺间质中达到有效浓度并防止尿道感染的发生，应提倡超大剂量和超时限(4～12周)的用药法。
前列腺注射的主要缺点：
①前列腺部位深，直接注射并非易事，穿刺可造成周围组织损伤并引起血尿;
②穿刺可造成疼痛不适，如反复进行，很难被患者接受;
③经皮肤或经直肠的穿刺，可将细菌带入，造成前列腺的重复感染;
④反复多次的穿刺可造成前列腺纤维组织增生、前列腺硬化，肛诊时前列腺内可扪及硬结，或扪及一质地坚硬的前列腺。纤维组织增生会造成病灶被分离包绕，抗菌素更难，且会使前列腺液的排出困难。
因此在选择这种治疗方法时一定要慎重，只有当其他方法都无效时，才考虑此法，且穿刺不能过于频繁，每周穿刺1～2次，疗程不要太长，应控制在1~2月左右。
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