鸡蛋和鸭蛋的营养价值各有侧重，鸡蛋蛋白质吸收率更高，鸭蛋则富含更多矿物质。选择需根据个人营养需求决定。
鸡蛋的蛋白质结构与人体更接近，消化吸收率可达九成以上，尤其适合健身人群和术后恢复者。蛋黄中卵磷脂含量突出，对神经系统发育有益，维生素A和维生素B2含量也较为丰富。蛋清中的溶菌酶具有一定抗菌作用。但鸡蛋胆固醇含量相对较高，三高人群需控制摄入量。
鸭蛋的钙、铁、锌等矿物质含量普遍比鸡蛋高约两成，适合贫血或骨质疏松人群。腌制后的咸鸭蛋虽会增加钠含量，但维生素B12含量会显著提升。鸭蛋蛋黄更大，脂肪含量略高，提供的能量更充足。部分人对鸭蛋的腥味较敏感，烹饪时可加姜片或料酒去腥。
建议健康人群交替食用两种蛋类，每周摄入3-5个为宜。水煮或蒸蛋能最大限度保留营养，避免高温煎炸。对蛋类过敏者应选择其他优质蛋白替代，特殊人群食用前可咨询营养师制定个性化方案。注意观察食用后是否有腹胀、皮疹等不适反应，储存时需冷藏并尽快食用。