多数性传播疾病的症状表现在生殖器上，如梅毒、淋病、尖锐湿疣等，病症表现在生殖器上。但是，也有性传染病，生殖器以外的器官全身发生，如艾滋病等容易引起误诊、误治。
淋菌性口腔、咽喉疾病
主要由口交引起。淋菌性口腔疾病的常见症状是口腔硬腭上出现赘肉，表面不平整，呈菜花状突出的喉咙疾病的常见症状是喉咙红肿，扁桃体增大，按上感治疗几乎没有效果。
淋菌性眼病
性传播疾病之一，有成人型、儿童型和婴儿型三种。成人型多是患者自己用手揉眼睛时感染的，儿童型多是父母或保姆感染的，婴儿型多是生孩子时出生的。莆田墟状主要表现为眼睑红肿、结膜充血、眼球表面形成片状假膜。起初可见红色水样或血样分泌物，红肿减轻后睑裂中会流出脓性分泌物，分泌物里有 大量的淋球菌。
直肠综合征
性传播疾病之一种，是一组以排便痛、痒、大便呈黏液为主要症状的疾病，多发于同性恋有直肠性交史者，少数患者是生殖道感染淋菌后传播到直肠部位，病原体多为淋病双球菌、梅毒螺旋体、沙眼衣原体、单纯疱疹病毒等。
淋浴性关节炎
淋浴性关节炎患者中的40%-60%是淋浴双球菌感染引起的。该病具有受累关节不对称、多关节发病、发病前皮肤有红斑脓疱或手足腱鞘炎等特点。80%的患者可以从宫颈、直肠、尿道或咽部培养淋球菌。
性传播疾病性肝周炎
这种疾病是性传播疾病的原体通过血液传播到肝脏，一部分患者表现为心肌心包炎、肺炎等。
常见症状有右上腹剧烈疼痛、压痛和反跳疼痛，伴有发烧、下腹疼痛等盆腔炎症状，但无肝肿大、黄疸的急腹症。其病原体为淋病双球菌、沙眼衣原体或支原体等。