阴茎发热的治疗需明确病因后针对性处理，可通过一般治疗、药物治疗、物理治疗等方式改善。
一、一般治疗
若阴茎发热由非感染性刺激引起，如局部摩擦、衣物刺激或轻微过敏，通常无须特殊用药。建议暂停可能引起刺激的活动，穿着宽松透气的棉质内裤，保持会阴部清洁干燥。避免使用含有香精或刺激性成分的沐浴产品清洗。每日用温水清洗即可，清洗后轻轻擦干。在此期间应避免性生活，观察症状是否在1至2天内自行缓解。
二、药物治疗
阴茎发热常见于感染性疾病，如包皮龟头炎、尿道炎等。包皮龟头炎可能与细菌、真菌感染或局部卫生不良有关，通常表现为阴茎头及包皮红肿、灼热、疼痛或分泌物增多。治疗需遵医嘱使用抗感染药物，例如针对细菌感染可使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等外用抗生素；针对真菌感染可使用克霉唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏等抗真菌药。尿道炎可能与淋球菌或非淋球菌感染有关，除尿道口灼热外，可伴有尿频、尿急、尿道口流脓。治疗需在医生指导下口服抗生素，如阿奇霉素片、左氧氟沙星片等。
三、物理治疗
对于部分因慢性前列腺炎引起的盆腔区域不适或放射至阴茎的灼热感，在药物治疗基础上，医生可能会建议辅助物理治疗。例如温水坐浴，通过盆底肌肉放松和局部血液循环改善来缓解症状。也可采用前列腺按摩等物理手段辅助引流炎性分泌物，但须由专业医务人员操作。这些方法旨在辅助消炎、缓解疼痛，不能替代根本性的抗感染治疗。
四、手术治疗
当阴茎发热反复发作且与明确的解剖结构异常有关时，可能需要考虑手术治疗。例如，包茎或包皮过长导致包皮垢积聚，难以彻底清洁，从而诱发反复的包皮龟头炎。对于这种情况，医生可能建议行包皮环切术。该手术通过切除过长的包皮，使阴茎头外露，从而易于清洁，从根本上降低感染风险。手术属于有创操作，需在感染控制后、于正规医疗机构由专业医生评估后进行。
五、中医调理
从中医角度，阴茎发热可能与下焦湿热、心火下移或阴虚火旺等有关。下焦湿热者常伴小便黄赤、舌苔黄腻，治疗以清热利湿为主，可遵医嘱使用八正散、龙胆泻肝丸等中成药。阴虚火旺者可能伴有手足心热、口干，治疗以滋阴降火为主，可遵医嘱使用知柏地黄丸等。中医强调辨证论治，须由中医师通过望闻问切明确证型后开具方药，不可自行盲目用药。
出现阴茎发热症状后，首要的是明确诊断，切忌自行用药掩盖病情。在治疗期间及康复后，都应保持良好的个人卫生习惯，每日清洗，勤换内裤。饮食上宜清淡，多喝水以增加尿量、冲刷尿道，避免辛辣刺激、油腻及过量饮酒，这些食物可能加重炎症反应。同时应注意休息，避免熬夜和过度劳累，保持规律作息有助于免疫力恢复。若伴有发热、全身乏力或疼痛加剧，应立即复诊。治疗完成后，也应定期复查，确保感染彻底清除，防止复发或转为慢性。