生理期同房可能增加感染风险、引发不适或加重经期症状，主要影响包括生殖道感染、子宫内膜异位症风险升高、经血逆流、性交疼痛以及免疫屏障削弱。
月经期宫颈口轻微扩张，经血排出使阴道酸碱环境改变，防御能力下降。此时同房可能将外界细菌带入生殖道，增加阴道炎、宫颈炎等感染风险。若伴侣携带病原体，还可能引发盆腔炎，表现为下腹坠痛、异常分泌物或发热。
性行为时子宫收缩可能导致经血逆流至盆腔，脱落的子宫内膜细胞在卵巢、输卵管等部位种植，长期可能发展为子宫内膜异位症。该疾病常伴随进行性痛经、不孕等问题，需通过腹腔镜手术确诊。
性交过程中的机械刺激会促进子宫收缩，部分经血可能通过输卵管进入腹腔。虽然人体免疫系统会清除大部分逆流经血，但反复发生可能诱发慢性炎症，与不孕症存在一定关联。
经期盆腔充血会使生殖器敏感度改变，阴道润滑度不足可能造成黏膜损伤。部分女性会出现痉挛性腹痛或头痛，性高潮引发的强烈宫缩可能加重痛经症状，影响性体验。
月经期体内雌激素水平降低，阴道黏膜变薄且局部免疫球蛋白分泌减少。此时同房可能增加HIV、乙肝等血源性传染病传播风险，尤其存在皮肤黏膜破损时感染概率显著上升。
建议生理期避免同房，优先选择其他亲密方式。若发生性行为，务必使用避孕套降低感染风险，事后用温水清洁外阴但避免阴道冲洗。经期结束后3天再恢复常规性生活，日常注意补充铁元素和维生素C预防贫血，穿着透气棉质内裤并每2小时更换卫生巾。出现持续腹痛、异常出血或发热症状需及时妇科检查，必要时进行白带常规或B超排查感染。保持适度运动如瑜伽散步可改善盆腔血液循环，但避免游泳等可能造成逆行感染的活动。