器质性与功能性问题的区别主要在于是否存在可检测的生理结构异常，器质性问题通常伴随组织损伤或病变，而功能性问题多由生理机能失调引起。
器质性疾病指通过影像学、病理学等检查可观察到器官组织结构改变的疾病，如子宫肌瘤、前列腺增生等。功能性问题则表现为器官运作异常但无实质性损伤，如肠易激综合征、功能性勃起功能障碍等。
器质性病变多由感染、外伤、肿瘤等直接损伤导致，例如盆腔炎引起的输卵管粘连。功能性异常常与神经调节紊乱、激素水平波动有关，如压力导致的月经不调。
器质性问题需依赖超声、CT等影像检查或活检确诊，如精索静脉曲张的彩色多普勒诊断。功能性诊断主要通过排除器质病变后结合症状判断，如功能性消化不良需先排除胃溃疡。
器质性疾病多需针对性消除病灶，如卵巢囊肿需腹腔镜手术。功能性问题以调节生理机能为主，如植物神经紊乱采用谷维素等调节药物。
器质性病变治愈后可能存在永久性结构改变，如睾丸炎愈后纤维化。功能性异常通过调理可完全恢复，如心因性性功能障碍经心理干预可痊愈。
建议出现相关症状时先进行系统检查排除器质性疾病。功能性调理可尝试规律作息、腹式呼吸训练、温水坐浴等自然疗法，饮食上增加富含B族维生素的全谷物和深海鱼，避免过量摄入咖啡因。适度进行凯格尔运动或盆底肌训练有助于改善功能性泌尿生殖问题，症状持续超过两周应及时就医复查。