他达那非的副作用通常较轻微且短暂，多数患者可耐受。常见副作用包括头痛、消化不良、肌肉酸痛、鼻塞和面部潮红，严重副作用如突发性听力丧失或持续勃起症较为罕见。
约15%使用者会出现轻度至中度头痛，与药物扩张血管作用相关。可通过适量饮水、休息缓解，若持续超过24小时需就医。
约10%患者服药后出现胃部不适或反酸，建议避免与高脂食物同服。症状明显者可尝试分次服药或咨询医生调整剂量。
7%左右使用者报告背部或四肢肌肉隐痛，通常48小时内自行消退。适度热敷和轻度拉伸有助于缓解症状。
因血管扩张导致的面部发热和鼻腔充血发生率约5%，一般2-3小时消失。避免饮酒可减轻此类反应。
少数患者可能出现短暂色觉改变或视物模糊，与视网膜磷酸二酯酶抑制有关。有视网膜病变史者需提前告知
使用他达那非期间建议保持适度水分摄入，避免与硝酸酯类药物同服。服药后出现胸痛、呼吸困难或勃起超过4小时应立即就医。健康饮食和规律运动有助于改善血管功能，可间接降低药物副作用发生概率。服药前应全面评估心血管健康状况，肝功能异常者需调整剂量。日常避免过度劳累和精神紧张，这些因素可能加重药物不良反应。