支原体阳性部分情况可自愈，但多数需结合具体症状和感染类型判断。自愈可能性与免疫力强弱、感染部位、是否合并其他疾病等因素相关。
免疫功能正常者可能通过自身免疫系统清除支原体，表现为无症状或轻微症状后转阴。但免疫力低下人群如糖尿病患者、长期服用免疫抑制剂者，自愈概率显著降低。
泌尿生殖道支原体感染自愈率低于呼吸道感染。生殖道支原体阳性易引发非淋菌性尿道炎或宫颈炎，需药物治疗；而肺炎支原体引起的上呼吸道感染部分儿童可自限性恢复。
无症状携带者存在自愈可能，但出现尿频尿痛、异常分泌物或持续咳嗽发热时，往往提示活动性感染，需阿奇霉素、多西环素等药物治疗。
同时检出淋球菌、衣原体等病原体时，自愈可能性极低。混合感染易导致盆腔炎、附睾炎等并发症，需联合用药治疗。
孕妇支原体阳性无论有无症状均需治疗，可能引发早产或新生儿感染。备孕夫妇检出生殖道支原体时，建议双方同步治疗以提高转阴率。
保持规律作息、补充维生素C有助于增强免疫力，但出现症状或高危人群应及时就医。治疗期间避免性生活，注意个人卫生，定期复查培养或核酸检测确认转阴。支原体耐药性检测对反复感染者尤为重要，可指导临床用药选择。日常可通过高温消毒贴身衣物、避免共用毛巾等措施预防交叉感染。