长期服用西地那非可能导致药物依赖、心血管负担增加、听力或视力异常、耐药性及心理依赖等问题。主要风险包括血压波动、头痛、鼻塞等副作用加重，严重时可能诱发心脑血管事件。
长期使用可能降低身体对药物的敏感性，导致需要更高剂量才能达到相同效果。部分患者可能因心理依赖而忽视勃起功能障碍的潜在病因，延误对高血压、糖尿病等基础疾病的治疗。
西地那非通过扩张血管发挥作用，长期服用可能加重心脏负荷。合并冠心病或服用硝酸酯类药物者可能出现严重低血压，夜间用药还可能引发体位性眩晕。
约3%使用者报告出现蓝视症或听力下降，长期服药可能加重这些症状。视网膜血管扩张导致的视物模糊通常可逆，但个别案例报道不可逆性听力损伤。
持续用药6个月以上可能使PDE5抑制剂疗效降低50%。部分患者会出现停药后勃起功能反弹性恶化，需通过间歇给药或联合治疗维持效果。
过度依赖药物可能引发焦虑或性表现压力，形成恶性循环。伴侣关系可能因将性生活完全寄托于药物而变得脆弱，忽视情感沟通的重要性。
建议有长期用药需求者每3个月评估心血管状况，优先治疗原发病因。配合有氧运动改善血管功能，控制油脂摄入减少动脉硬化风险。地中海饮食模式有助于维持内皮健康，心理疏导可降低对药物的心理依赖。出现持续头痛或心悸应立即就医，避免与葡萄柚汁同服以防药物蓄积。