避孕套无法完全预防HPV、阴虱、疱疹等通过皮肤接触传播的疾病，正确使用可降低艾滋病、淋病等风险。
人乳头瘤病毒通过生殖器皮肤接触传播，避孕套未覆盖区域可能残留病毒。定期筛查HPV疫苗可预防高危型感染，治疗方法包括冷冻疗法、激光手术或局部用药咪喹莫特。
阴虱通过毛发接触寄生，避孕套无法阻断其传播。需剃除阴毛并使用扑灭司林洗剂，床单衣物需高温消毒。伴侣需同步治疗避免反复感染。
HSV病毒在无症状期仍可通过皮损分泌传播，避孕套无法完全防护。抗病毒药物如阿昔洛韦可抑制发作，保持患处干燥能加速愈合。
一期梅毒硬下疳常出现在避孕套未覆盖的会阴部。青霉素注射是首选治疗方案，早期治疗可避免神经梅毒等并发症。
由痘病毒引起的皮肤赘生物通过直接接触传播，刮除术或液氮冷冻可去除疣体。避免抓挠防止自体接种传播。
日常补充维生素C和锌元素增强免疫力，穿透气棉质内裤减少摩擦刺激。性行为后及时清洁外阴，避免使用碱性洗剂破坏黏膜屏障。定期进行HIV/梅毒联合检测，高危暴露后72小时内可服用阻断药物。游泳、桑拿等公共场所需注意个人物品隔离存放。