腘窝囊肿可通过药物注射、手术切除、物理疗法、中医调理和日常护理综合治疗。
囊肿较小且无感染时，医生可能建议皮质类固醇注射。常用药物包括曲安奈德、倍他米松，配合利多卡因局部麻醉。注射后需加压包扎24小时，避免剧烈运动。反复发作或合并感染需联用抗生素如头孢呋辛、阿莫西林克拉维酸钾。
关节镜微创手术适用于直径超过3cm的囊肿，通过3个5mm切口完整剥离囊壁。开放手术用于粘连严重病例，术后需石膏固定2周。关节腔探查术可同步处理半月板损伤等原发病，降低复发率至5%以下。
超声波治疗能促进积液吸收，每周3次连续2周。脉冲射频可抑制滑膜增生，配合冷敷缓解肿胀。康复期进行直腿抬高训练，每日3组每组15次，增强股四头肌力量。
外敷金黄散可消肿止痛，内服四妙散加减改善湿热下注体质。针灸取穴委中、阳陵泉等，隔日1次连续4周。艾灸足三里能温经通络，每次15分钟需避开皮肤破损处。
使用护膝减少膝关节压力，避免深蹲和爬楼梯。控制体重至BMI＜24，减轻关节负荷。睡眠时垫高患肢15cm，促进淋巴回流。
饮食建议补充胶原蛋白如牛筋汤、鱼胶，每日钙摄入不低于800mg。康复期可进行游泳、骑自行车等低冲击运动，避免篮球等高强度运动3个月。定期复查超声监测复发情况，术后6个月内每月随访1次。膝关节保暖尤为重要，寒冷季节可使用远红外护膝。