避孕套无法完全预防HPV、阴虱、疱疹等通过皮肤接触传播的疾病，但能有效阻断HIV、淋病等体液传播疾病。
人乳头瘤病毒通过皮肤黏膜接触传播，避孕套未覆盖的生殖器区域仍可能感染。治疗方法包括局部用药咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素、冷冻疗法或激光手术。定期宫颈癌筛查TCT、HPV检测对女性尤为重要。
阴虱通过体毛接触寄生，避孕套无法阻挡其传播。需剃除阴毛并使用灭虱药物氯菊酯洗剂、马拉硫磷乳液，高温消毒贴身衣物。伴侣需同步治疗避免交叉感染。
HSV-2病毒通过疱疹溃疡直接传播，发病期即使使用避孕套也可能感染。抗病毒治疗阿昔洛韦、泛昔洛韦可缩短病程，日常需保持患处干燥清洁。
一期梅毒的硬下疳常出现在避孕套未覆盖的会阴部。青霉素注射是首选疗法，对青霉素过敏者可选用多西环素。治疗后需定期进行RPR滴度检测。
由痘病毒引起的皮肤病变通过直接接触传播。治疗采用夹除术、液氮冷冻或外用西多福韦膏剂。避免抓挠防止自体接种传播。
坚持使用避孕套仍可降低80%以上性病风险，配合接种HPV疫苗、定期体检能提升防护效果。日常需注意外阴清洁，避免共用毛巾浴具，性行为后及时用温和洗液清洗。出现异常分泌物、溃疡或瘙痒症状应立即就医，延误治疗可能引发盆腔炎、不孕等严重后果。合理膳食补充维生素C、锌元素和适度运动有助于维持生殖系统免疫力。