西地那非在规范使用下安全有效，但存在头痛、视觉异常、心血管风险等潜在副作用，需严格遵医嘱。
西地那非通过扩张血管改善勃起功能，可能引发血压波动。高血压或冠心病患者使用硝酸酯类药物时禁止联用，否则可能导致致命性低血压。建议用药前进行心电图检查，避免剧烈运动后立即服药。替代方案可选择他达拉非等半衰期较长的PDE5抑制剂。
约3%使用者出现蓝视症或光敏感，与视网膜PDE6酶抑制有关。糖尿病视网膜病变患者风险增加，需进行眼底检查。症状持续超过24小时需立即停药就医。维生素A补充可能缓解症状，但需避免与异维A酸同服。
常见头痛头晕发生率约16%，与脑血管扩张相关。偏头痛患者可提前服用布洛芬预防。避免与葡萄柚汁同服加重反应。出现持续性耳鸣需考虑前庭神经损伤可能，建议换用伐地那非。
消化不良发生率约7%，与平滑肌松弛延缓胃排空有关。建议餐后2小时服药，避免高脂饮食影响吸收。奥美拉唑可缓解症状，但需间隔4小时服用。长期使用可能引发药物性肝炎，需定期监测转氨酶。
心理依赖多见于自行超剂量使用者，可能加重勃起功能障碍。建议联合心理治疗，每周用药不超过2次。可逐步替换为低剂量他达拉非每日疗法，配合盆底肌训练改善自然勃起功能。
使用西地那非期间应保持低盐饮食，每日钠摄入控制在1500mg以内，适量补充镁元素改善血管功能。避免高强度无氧运动，推荐快走、游泳等有氧运动增强心血管耐力。服药后4小时内避免热水浴，定期监测血压和肝功能指标。存储需避光防潮，超过有效期或性状改变立即停用。