安全套能有效降低性传播疾病风险，预防效果与正确使用、材质选择、覆盖范围、病原体类型以及配合其他措施有关。
安全套预防性传播疾病的核心在于规范操作。使用前检查有效期和包装完整性，佩戴时捏住储精囊排出空气，全程覆盖阴茎并避免中途脱落。乳胶或聚氨酯材质能阻隔HIV、淋病、衣原体等多数病原体，但单纯疱疹病毒可能通过未覆盖的皮肤接触传播。使用后打结丢弃，避免重复使用。
乳胶安全套对HIV的阻隔率可达98%，聚氨酯材质适用于乳胶过敏者但弹性稍差。天然材质如羊肠膜因存在微小孔隙，无法有效阻挡病毒。选择带有润滑剂的安全套能减少摩擦破损，水基润滑剂比油基更适合配合乳胶使用。
安全套无法完全预防通过皮肤接触传播的疾病，如梅毒硬下疳、尖锐湿疣可能出现在阴囊或会阴等未覆盖区域。人乳头瘤病毒HPV可通过安全套未覆盖的生殖器皮肤接触传播，接种HPV疫苗可补充防护。
不同病原体穿透力存在差异。HIV病毒无法穿透完整乳胶，但乙肝病毒在体外存活能力更强。阴虱、疥疮等寄生虫主要通过皮肤接触传播，安全套防护效果有限。定期筛查和单一性伴侣可降低暴露风险。
安全套需配合其他措施提升防护效果。暴露前预防PrEP药物可降低HIV感染风险，避孕凝胶能抑制部分病原体活性。避免酗酒等高风险行为，性行为后及时清洁也能减少感染概率。
坚持使用安全套的同时，建议每年进行衣原体、淋病、HIV等常规筛查。日常补充维生素C和锌元素有助于维持黏膜免疫力，适度运动如快走或游泳可改善血液循环。选择棉质透气内裤，避免穿紧身裤减少局部潮湿。出现异常分泌物或溃疡需立即就医，早期治疗可显著改善梅毒、生殖器疱疹等疾病的预后效果。