父亲去世后可通过特殊样本比对完成亲子鉴定，主要方法有直系亲属基因反推、遗物DNA提取、兄弟姐妹参与鉴定、家族基因库比对、司法机构协助。
当父亲直系血亲如父母或子女在世时，可通过他们的基因样本进行逆向推导。实验室通过分析祖孙三代的Y染色体或线粒体DNA遗传规律，计算出生父基因序列概率。常用样本为祖父母口腔黏膜细胞或子女静脉血，准确率可达99%以上。
收集父亲生前遗留的含有细胞核物质物品，如剃须刀上的毛囊、牙刷口腔细胞、贴身衣物汗渍等。专业机构采用STR分型技术从降解样本中提取有效DNA，需至少3件以上遗物交叉验证，成功率约60-80%。
通过父亲其他子女的基因比对间接确认亲子关系。全同胞鉴定需检测21个基因座，半同胞需检测40个以上基因位点。兄弟姐妹每多参与1人，准确率提升15%，建议至少2位同父异母兄弟姐妹配合检测。
若父亲生前参与过商业基因检测或科研项目，可联系23andMe等机构调取原始数据。部分民族地区建有Y染色体族谱库，通过姓氏溯源匹配父系单倍型，适合三代内有明确族谱记录的家庭。
涉及遗产继承等法律纠纷时，可申请法院调取父亲医疗档案中的病理标本。医院保存的活检组织、血库存档最长有效期为20年，需持公证文书提取，司法鉴定所采用SNP芯片技术确保结果具有法律效力。
日常注意保存父亲遗留的毛发、指甲等生物样本于干燥避光环境。选择鉴定机构时认准CMA认证实验室，提前确认样本可用性。运动方面避免剧烈活动影响血液样本质量，饮食上检测前24小时忌烟酒。特殊情况下可采用叔伯等旁系亲属进行亲缘指数计算，但需增加检测位点至60个以上。