阴茎萎缩可能由年龄增长、激素水平下降、血液循环障碍、神经损伤或心理因素引起。
随着年龄增长，男性睾酮水平自然下降，海绵体组织弹性减弱导致视觉上尺寸缩小。建议检测血清睾酮，水平低于300ng/dL时可考虑激素替代治疗，如十一酸睾酮胶丸、丙酸睾酮注射液或贴剂。配合凯格尔运动每天3组，每组15次，能改善盆底肌支撑力。
动脉硬化或糖尿病引发的微循环障碍会使阴茎供血减少，勃起时充血不足显得萎缩。需检查空腹血糖和血管超声，药物可选西地那非改善血流，严重者需进行阴茎血管成形术或静脉结扎术。每日30分钟快走或游泳促进全身血液循环。
腰椎间盘突出、前列腺手术或糖尿病神经病变可能影响支配阴茎的神经。核磁共振可明确损伤位置，治疗包括甲钴胺营养神经、低频电刺激疗法，重度患者需考虑阴茎假体植入术。摄入富含维生素B1的糙米、燕麦有助于神经修复。
长期焦虑或体像障碍会导致主观认知偏差，实际尺寸未变化但自觉萎缩。心理量表评估后可采用认知行为疗法，配合腹式呼吸训练每日2次。避免过度测量阴茎尺寸，减少视觉对比引发的焦虑。
佩罗尼氏病等器质性疾病会造成阴茎纤维化缩短，需通过超声检查确诊。早期可注射胶原酶或进行病灶切除手术，晚期需移植真皮补片。日常避免阴茎外伤，控制炎症性疾病发展。
保持均衡饮食多摄取锌元素牡蛎、牛肉、维生素E坚果、菠菜，适度有氧运动维持血管健康。避免过紧内裤压迫，寒冷季节注意会阴部保暖。观察三个月无改善需到男科进行阴茎血流多普勒检测，排除器质性病变。规律性生活有助于维持阴茎组织活性，但过度手淫可能加重心理负担。