囊肿是否需要手术取决于类型、大小、位置及症状，常见处理方法包括观察、药物干预、穿刺引流、微创手术、传统切除。
体积较小且无症状的囊肿通常无需手术，定期超声监测即可。例如肝囊肿直径＜5cm或卵巢生理性囊肿，每6-12个月复查一次，多数可自行吸收。若出现增长加速或形态异常需及时干预。
感染性囊肿可尝试抗生素治疗，如头孢曲松联合甲硝唑。内分泌相关囊肿如乳腺囊肿可能采用激素调节药物，如他莫昔芬或口服避孕药。药物治疗期间需监测肝肾功能。
适用于位置表浅的单纯性囊肿，如肾囊肿或甲状腺囊肿。在超声引导下穿刺引流囊液，并注入无水酒精硬化囊壁。该方法创伤小但复发率约15%-30%，可能需重复操作。
腹腔镜/宫腔镜适用于卵巢囊肿、输卵管系膜囊肿等妇科病变。通过3-4个5mm切口完成囊肿剥离，保留正常组织。术后住院2-3天，恢复期比开腹手术缩短50%。
巨大囊肿＞10cm、疑似恶变或压迫重要器官时需传统手术。如胰腺假性囊肿合并感染需行囊肿空肠吻合术，术后需放置引流管2-4周。复杂病例可能联合脏器部分切除。
日常需避免囊肿部位外力撞击，饮食注意控制豆制品、蜂王浆等植物雌激素摄入。适度进行快走、游泳等有氧运动促进代谢，术后患者应遵医嘱进行肌肉拉伸训练。囊肿直径超过4cm或伴随持续疼痛、发热、异常出血时需立即就医，特殊人群如孕妇出现卵巢囊肿蒂扭转需急诊手术处理。