紧急避孕药可能引起短期身体不适，但正确使用不会造成长期伤害，常见影响包括激素波动、月经紊乱、胃肠道反应、头痛眩晕、乳房胀痛。
左炔诺孕酮等紧急避孕药通过高剂量孕激素抑制排卵，可能引发内分泌暂时失衡。建议服药后观察1-2个月经周期，若持续紊乱需检查性激素六项，必要时采用短效避孕药调节周期。
药物干扰子宫内膜脱落周期，30%使用者会出现提前或延迟月经。月经量异常时建议超声检查子宫内膜厚度，排除器质病变后可服用益母草胶囊或当归调经颗粒辅助恢复。
药物刺激胃黏膜导致20%使用者出现恶心呕吐，服药前可服用铝碳酸镁片保护胃黏膜。严重呕吐需在2小时内补服，配合甲氧氯普胺缓解症状。
孕激素影响下丘脑体温调节中枢，可能引发偏头痛或体位性低血压。出现眩晕时应立即平卧休息，症状持续超过24小时需排除前庭神经炎，可服用布洛芬缓解头痛。
激素变化导致乳腺导管水肿，表现为触痛或胀感。建议穿戴无钢圈内衣，局部冷敷缓解，若出现结节需做乳腺超声鉴别生理性增生与病理性肿块。
服用后两周内避免摄入酒精、咖啡因等刺激性物质，每日补充400μg叶酸降低卵巢应激。适度进行瑜伽或快走促进代谢，服药后3个月经周期内建议使用避孕套防护。出现严重腹痛、视力模糊或胸痛需立即就医，排除血栓风险。哺乳期女性服药需暂停母乳喂养48小时，期间定时排空乳汁。