男性生殖器疼痛可能由泌尿感染、前列腺炎、精索静脉曲张、外伤或性传播疾病引起，需根据病因选择抗生素、抗炎药或止痛药。
细菌侵入尿道或膀胱引发炎症，表现为排尿灼痛、尿频。口服左氧氟沙星、头孢克肟等抗生素治疗，配合三金片辅助消炎，每日饮水2000ml以上冲刷尿道。
久坐或细菌感染导致前列腺充血肿胀，引发会阴部胀痛。选用坦索罗辛缓解尿路梗阻，布洛芬减轻疼痛，辅以前列舒通胶囊改善循环，避免辛辣食物刺激。
阴囊静脉回流受阻引发坠痛感，左侧多发。轻症服用七叶皂苷钠改善循环，严重需腹腔镜高位结扎术，日常穿阴囊托带减轻压力。
运动撞击或性生活不当造成组织损伤。急性期冷敷缓解肿胀，口服对乙酰氨基酚止痛，破损处涂抹莫匹罗星软膏预防感染。
淋球菌或衣原体感染需肌注头孢曲松，配合多西环素口服，伴侣需同步治疗。疼痛剧烈时可短期使用塞来昔布。
日常增加冬瓜、绿豆等利尿食物摄入，避免骑行等压迫会阴的运动。棉质内裤每日更换，出现持续疼痛、血尿或发热需立即泌尿科就诊。未明确病因前勿自行服用抗生素，以免掩盖病情。