紧急避孕药可能引起短期不适但总体安全，主要风险包括激素紊乱、月经异常、肠胃反应、头痛眩晕及长期频繁使用的内分泌影响。
左炔诺孕酮等紧急避孕药通过高剂量孕激素抑制排卵，可能造成暂时性激素水平波动。表现为乳房胀痛、情绪波动，通常2-3个月经周期后自行恢复。建议服用后监测基础体温，若持续高温相超过16天需验孕。
约30%使用者会出现撤退性出血或周期紊乱，与用药时月经周期阶段相关。排卵前服用可能提前月经，黄体期服用则可能延迟。连续两次周期异常需排查多囊卵巢综合征等潜在疾病。
服药后2小时内呕吐需补服剂量，建议搭配维生素B6缓解恶心。米非司酮类可能引发腹泻，可预先准备蒙脱石散。食物不影响药效，但高脂饮食可能延缓吸收。
约15%人群出现头痛，与前列腺素分泌增加有关。布洛芬可缓解症状，避免联用阿司匹林以防加重出血。眩晕多发生在服药后8小时内，建议卧床休息。
每年使用超过3次可能干扰下丘脑-垂体-卵巢轴，导致月经稀发。有乳腺癌家族史者慎用，但无证据表明单次用药致癌。流产后立即服用可能影响子宫内膜修复。
饮食宜选择富含维生素B族的燕麦、香蕉缓解不适，避免经期剧烈运动。紧急避孕药失败率约15%，月经延迟7天需检测。哺乳期女性服药后暂停哺乳36小时，宫内节育器是更可靠的紧急避孕选择。日常推荐采用复方短效避孕药、避孕套等常规方法，每年妇科检查包括乳腺超声和激素六项评估。