安全套正确使用利大于弊，但可能引发过敏反应、降低敏感度、使用不当导致脱落破裂、材质选择不当引发不适、心理因素影响性体验。
乳胶安全套可能引发接触性皮炎，表现为生殖器红肿瘙痒。对乳胶过敏者可选用聚氨酯或聚异戊二烯材质安全套，症状严重时需口服氯雷他定等抗组胺药物，局部涂抹氢化可的松软膏缓解炎症。
安全套的物理阻隔会使阴茎触觉反馈减弱，超薄型安全套能改善这个问题。选择厚度0.01-0.03mm的聚氨酯安全套，配合水性润滑剂减少摩擦损耗，中断性行为时适当调整佩戴位置。
尺寸过大易滑脱，过紧可能造成破裂。测量阴茎周长选择合适尺寸，使用前检查保质期，撕开包装避免锐物划伤，佩戴时捏住储精囊排出空气，射精后及时按住套体基部退出。
含苯佐卡因的延时安全套可能引起麻木感，香味安全套的化学添加剂刺激黏膜。选择无添加的天然胶乳安全套，敏感体质建议使用医用级灭菌产品，避免使用含Nonoxynol-9杀精剂的产品。
部分使用者认为安全套影响亲密感，产生心理性勃起障碍。可通过前戏时共同佩戴增加情趣，选择半透明材质维持视觉连接，逐步适应安全套的佩戴习惯。
日常注意避免阳光直射和高温存放安全套，性行为前后用温水清洁外生殖器。增加深海鱼类和坚果摄入有助于维持黏膜健康，凯格尔运动能提升性器官血液循环。出现持续不适需排查是否合并真菌感染或泌尿系统炎症，必要时进行斑贴试验确定过敏原。