安全套无法完全预防的疾病包括HPV感染、生殖器疱疹、阴虱、梅毒硬下疳和乙肝病毒，主要通过皮肤黏膜接触、体液交换或间接传播途径感染。
人乳头瘤病毒通过皮肤黏膜接触传播，安全套无法覆盖全部生殖器区域。治疗方法包括局部用药咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素、冷冻治疗或激光手术，高危型需定期宫颈癌筛查。
HSV病毒通过疱疹溃疡渗出液传播，安全套无法完全阻断病毒。急性期口服阿昔洛韦、泛昔洛韦等抗病毒药物，复发期可采取抑制疗法，避免性接触直至皮损结痂。
阴虱通过体毛接触或共用衣物传播，安全套无法防护。使用林旦洗剂或扑灭司林处理患处，需高温消毒床单衣物，剔除阴毛可阻断寄生虫生存环境。
一期梅毒的硬下疳常出现在安全套未覆盖部位。确诊后需肌注苄星青霉素，替代方案包括多西环素或头孢曲松，伴侣需同步治疗避免重复感染。
HBV可通过精液、阴道分泌物以外的体液传播。暴露后需接种乙肝疫苗和免疫球蛋白，慢性患者需长期服用恩替卡韦、替诺福韦等抗病毒药物。
日常需保持外阴清洁干燥，避免共用剃须刀等个人物品。饮食中增加富含维生素C的柑橘类水果和锌含量高的牡蛎，适度运动增强免疫力。定期进行性病筛查，接触可疑皮损后及时用碘伏消毒。安全套虽能降低大部分性病风险，但皮肤密切接触区域的疾病仍需综合防护措施。