亲子鉴定结果80%为亲生属于低概率事件，常规检测准确率超99%，误差多与样本污染、技术局限或人为干预有关。
采用STR检测时，基因座数量不足或突变可能导致结果偏差。升级检测至21个以上基因座，配合SNP分型技术可提升精度。实验室需通过CNAS认证，避免试剂灵敏度差异。
口腔拭子被他人DNA污染、血样运输中降解会影响数据。规范采样需监督人员在场，冷冻保存样本。二次采集比对可排除运输因素，毛发需带毛囊才有效。
生殖细胞突变会使1-2个基因座不符，检测时需计算突变率。补充检测母系线粒体DNA或Y染色体标记，突变累积分析可确认亲缘关系。
叔侄间基因相似度达25%，易造成假阳性。增加检测祖父母样本，采用家系重建分析法，计算亲缘指数可区分直系与旁系血缘。
个别机构伪造报告需警惕。选择司法鉴定所，报告需有CMA标志。复核时可委托异地实验室，比对两份结果的一致性。
日常避免剧烈运动后采样以防细胞代谢干扰，检测前24小时禁烟酒减少基因表达变异。鱼类等富含DNA的食物不影响检测，但采样前需清洁口腔。选择有法医物证资质的机构，保存采样全程录像，报告应包含检测方法、基因座数据和统计学亲权指数。孕期无创亲子鉴定需采集10毫升外周血，孕周需达7周以上。