如果在怀孕早期出现胚胎停止发育的情况，在进行人工流产时可以将宫腔内的残留物清除干净。但是部分女性可能由于子宫壁比较厚或者残留组织比较大等情况而存在清不干净的可能性。
1.一般能够清理干净：如果是在怀孕8-10周之内发生的胚胎停止发育，此时孕囊相对较小，而且与周围组织之间的间隙比较宽广，所以在进行负压吸引流产手术后，通常都能够将全部的妊娠物完全吸出，并且子宫腔内不会出现残留的现象。还有一种情况是发生在怀孕12周以后，此时已经形成较为成熟的胎儿以及羊水等物质，所以发生胚胎停止发育之后再做引产手术，也可以通过使用缩宫素促进子宫收缩，从而促使胎儿和附属物排出体外，也有助于减少术后感染的发生概率。
二、不能够清理干净
若女性本身体质较差，如多次人流史导致宫颈口过紧或天生宫颈口较紧，则可能会增加人流不全的风险。另外，如果女性在怀孕期间受到外界因素刺激，比如病毒感染或者是服用药物不当等原因，也有可能会导致胚胎停止发育。针对此类情况则需要根据医生建议选择其他方法处理，如再次刮宫等。
在日常生活中要注意做好避孕措施，避免意外怀孕对身体造成不必要的伤害。同时还要注意个人卫生，勤换洗内衣裤，以免引起妇科疾病。