根据病因，男性性功能障碍一般可分为功能障碍和器质障碍，临床功能障碍引起的性功能障碍较为常见。功能障碍引起的男性性功能障碍与大脑皮层功能障碍对性中枢控制的病理变化密切相关。
①大脑皮质对高级中枢抑制过程的病理偏好
当大脑皮层对先进中枢抑制过程的病理过程较高时，会出现性功能障碍的各种症状：只能影响勃起中枢的功能，表现为阳痿和不射精；也会影响性功能的整个过程，表现为性欲低下、勃起减弱和性交情绪低下或不能勃起。
当勃起中心抑制过度时，通常性欲正常，勃起不强；或者当性交时，完全不能勃起。当大脑皮层抑制射精中心时，性欲和勃起可以正常；但性交可以继续，但没有情绪高潮和射精，或晚泄。当大脑皮层中心在睡眠中缓解过度抑制时，遗精仍然可以由于梦见的色情或无梦遗精而发生。
②大脑皮质对高级中枢兴奋过程的病理偏好
大脑皮层对高级中枢兴奋过程的病理偏好在性生活过频、性交时间延长过多或试图通过多次中断性交来暂停射精的人中很常见。未婚手淫也是原因之一。
高级中枢兴奋过程的基本特征是性欲增强或兴奋，表现为勃起、射精快或早泄，甚至在看到或听到色情或思想上的色情概念时。这些症状并不表明性功能的增强，因为内部抑制过程的减弱和兴奋和抑制平衡的减弱实际上只是表明其性功能的下降，而只是发展过程的初始阶段。
③脊髓性中枢功能障碍
脊髓中枢功能障碍患者的临床表现为：当勃起中枢兴奋性高时，易勃起；当射精中枢兴奋性高时，表现为射精快或早泄；也可同时发生。当勃起中心转向抑制高或衰竭，射精中心兴奋性仍高时，勃起减弱或不能勃起，射精仍正常或更快。当两个中心都耗尽时，它们既不能勃起也不能射精。
一般来说，上述类型的性功能障碍患者在临床实践中更为常见，主要与一些不良的生活习惯和各种心理压力对中枢神经系统的不利影响有关。建议患者改变不良的生活习惯，放松，这对性功能障碍的恢复非常有帮助。