长期痛经本身不一定会直接导致不孕，但痛经背后可能存在的疾病，如子宫内膜异位症、子宫腺肌症等，是导致不孕的重要原因。因此，需要区分是原发性痛经还是继发性痛经。
大多数原发性痛经，即生殖器官没有器质性病变的痛经，通常与月经时子宫内膜前列腺素含量增高有关，这种痛经一般不会影响生育能力。这类痛经多在初潮后1-2年内出现，疼痛通常在月经来潮前或来潮后开始，持续48-72小时，常伴有恶心、呕吐、腹泻等症状。对于原发性痛经，通过生活方式调整，如经期注意保暖、避免生冷食物、适度进行瑜伽或散步等温和运动，以及遵医嘱使用布洛芬缓释胶囊、萘普生片、酮洛芬肠溶胶囊等非甾体抗炎药，可以有效缓解疼痛，且不会对生育造成长期影响。
少数情况下，长期痛经是继发性痛经，由盆腔器质性疾病引起，这些疾病是导致不孕的直接原因。最常见的病因是子宫内膜异位症，即子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位，这些异位的内膜同样会随月经周期出血，导致盆腔粘连、卵巢功能受损，影响卵子排出和受精。子宫腺肌症，即子宫内膜侵入子宫肌层，会导致子宫增大、月经量增多和严重痛经，可能影响胚胎着床。此外，盆腔炎性疾病后遗症、子宫肌瘤等也可能引起继发性痛经。这类痛经的特点是疼痛进行性加重，月经来潮前即开始，持续整个经期甚至经后。对于这类情况，需要及时就医，通过妇科超声、腹腔镜等检查明确诊断。治疗上，医生可能会根据病因建议使用地屈孕酮片、醋酸甲羟孕酮片、促性腺激素释放激素激动剂等药物，或进行腹腔镜手术、宫腔镜手术等，以去除病灶、恢复盆腔正常结构，从而提高受孕概率。
对于长期痛经的女性，建议记录自己的月经周期、疼痛程度和伴随症状。如果痛经严重影响生活，或伴有月经量过多、经期延长、非经期出血、性交疼痛等症状，应及时到妇科就诊，进行子宫附件超声、血清CA125等检查，以排除继发性痛经的可能。日常生活中，保持规律作息、均衡饮食、适度运动，有助于改善整体内分泌状态。在备孕前，进行全面的孕前检查，包括妇科检查、激素水平检测等，有助于及早发现和处理可能影响生育的问题。