体外射精的最大缺点是避孕率低，其失败原因主要有三点。
第一，性过程中，随着性兴奋的提高，男性生殖系统内的各种腺分泌开始活跃，分泌液和一部分精囊液在射精前溢出尿道口进入女性生殖道。这部分分泌液含有一定数量的精子细胞。
第二，很多男性不能掌握射精的正确时间，阴茎拔出阴道的时间太晚，精液容易留在阴道内或阴道外口。
第三，女性阴道口周围周围、男性阴茎或其他部位的精液，由于可能的原因进入女性生殖道。
偶尔一两次体外射精，对人体影响不大。但是，一些临床医生建议长期性交中断会导致性感下降或其他功能障碍。例如，女性在不知不觉中，男性用这种方法射精，或者女性强迫男性实施体外射精，随着时间的推移，男性会出现心理不安、不满意、性满意度下降等问题，进一步发展会大幅度降低对性的感觉，性高潮的感觉下降或者不足除此之外，即使双方都知道，也有危险。男性不能掌握射精的正确时间，担心避孕失败，会引起操作性不安，时间变长也会引起男性射精过快或不射精，影响女性的性感。临床上，一些患者长期采用这种方法，准备生育时不能在阴道内射精。这可能是由于长期射精习惯和性刺激强度的不同，可以通过矫正射精习惯来改善阴道射精。