苦荞茶一般不适合低血糖人群、胃肠功能较弱者及孕妇饮用。苦荞茶含有黄酮类化合物和膳食纤维，可能引起血糖波动、胃肠不适或影响胎儿发育。
苦荞茶中的芦丁等活性成分可能辅助降低血糖，对于本身存在低血糖或正在服用降糖药物的人群，饮用后可能出现心悸、头晕等低血糖反应。这类人群日常可选择温和的枸杞茶或红枣茶替代，饮用前建议监测血糖水平。
苦荞茶中丰富的膳食纤维可能刺激胃肠黏膜，脾胃虚寒或慢性胃炎患者饮用后易出现腹胀、腹泻等症状。胃肠敏感者若想尝试，可将苦荞茶浓度调低并与餐食同服，或选择发酵程度较高的熟普洱等茶饮。
苦荞茶含有的槲皮素等成分可能影响激素水平，孕早期饮用存在潜在风险。孕期建议优先饮用低咖啡因的玫瑰花茶、菊花茶等，若需补充营养可选择孕妇专用复合维生素制剂。
健康人群饮用苦荞茶时建议控制每日摄入量不超过400毫升，避免空腹饮用。可搭配少量坚果或全麦饼干缓解对胃肠的刺激。初次尝试者应从低浓度开始，观察是否有过敏反应。特殊体质或慢性病患者饮用前应咨询医师，经期女性、术后恢复期人群也需谨慎选择。日常储存需密封避光，防止苦荞茶氧化变质。