隐睾是影响精液质量的重要原因之一。有研究报道，单侧隐睾患者约有30%～60%不育，双侧隐睾则有50%～100%发生不育，少精症中隐睾患者约占9%。单侧隐睾约60%病人不育，因此若精子密度低，又有隐睾存在，必须及早治疗。
精索静脉曲张
精索静脉曲张时，使睾丸的局部温度升高，血管活性物质增加，从而影响睾丸生精功能，但精索静脉曲张程度与精子质量不成比例。
阴囊温度过高
睾丸中专门用来制造精子的曲精管对温度变化非常敏感，这个部位适宜温度比人体体温要低2～3℃，温度过高容易抑制精子的生存和成熟，造成精液中精子数量减少或活动能力降低。因此，男性朋友应少穿紧身裤，少洗桑拿浴，避免电磁辐射和高温，养成良好的生活习惯。
自身免疫
生殖免疫学研究发现，男性自身免疫可影响生育能力，抗精子抗体可影响精子的产生和运送。男性正常生精功能依赖于下丘脑-垂体-性腺轴功能的正常，其中任何一个环节障碍，都会影响生精功能，其它如甲状腺、肾上腺疾病也会影响生殖腺功能而致少精子症。