避孕套001和003的安全性主要取决于正确使用方式，两者在材质和防护效果上均符合国际标准。001采用聚氨酯材质，厚度约0.01毫米，003多为乳胶或聚异戊二烯材质，厚度约0.03毫米，均能有效阻隔病毒和精子。
001的聚氨酯材质具有超薄特性，使用时贴合度更好，能减少异物感，适合对乳胶过敏的人群。其分子结构致密，防护性能与乳胶套无显著差异，但材质弹性较低，需注意使用中避免撕裂。003的乳胶或聚异戊二烯材质延展性更强，适应不同尺寸需求，且价格通常更低。乳胶材质天然具有微孔结构，但通过国家标准检测的合格产品孔隙直径远小于病毒和精子尺寸，安全性有保障。
两种避孕套均需全程规范使用才能确保防护效果。001因厚度更薄可能增加使用不当导致的破裂风险，需配合水基润滑剂降低摩擦损伤。003的乳胶材质与油性润滑剂接触可能降低强度，需避免搭配使用。选择时需结合自身材质适应性、舒适度及经济因素，优先选购通过国家医疗器械认证的产品。
无论选择001或003，均需检查包装完整性、有效期及认证标志，使用前排除套体破损。日常存放应避光防潮，开封后立即使用。若出现滑脱或破裂，建议72小时内采取紧急避孕措施并筛查性传播疾病。长期避孕可结合其他避孕方式提升安全性，如短效避孕药或宫内节育器。