1.输精管阻塞
有一小部分男性会出现输精管堵塞，导致精子不能进入精液。感染、受伤、先天性缺陷或输精管切除术都会导致输精管堵塞。
2.精索静脉曲张
精索静脉曲张指阴囊内的静脉扩张，这种曲张类似身体其他部分的静脉曲张，会使睾丸内温度升高，从而影响精子的产生。通常能在体检过程中才被发现。
3.精子异常
如果你存在精子数量少、无精、精子活力(指精子的游动能力)低下或畸形精子等问题，那么你的精子可能无法自然地使妻子的卵子受精。
4.免疫因素
可分为两类，由男性产生的抗精子自身免疫和由女性产生的抗精子同种免疫。精子与免疫系统由于血睾屏障的作用而隔离，故无论对男性或女性，精子抗原为外来抗原，具有很强的抗原性。血睾屏障及精浆内免疫抑制因子等因素共同建立了一套完整的免疫耐受机制，当发生睾丸炎、附睾炎、前列腺炎、精囊炎，或行输精管结扎等手术后，上述免疫耐受机制被破坏，即可能发生抗精子免疫反应。
5.射精障碍
射精障碍包括完全不射精和逆行射精等。逆行射精是指精子未射出或是逆行射入膀胱。造成射精障碍的原因包括糖尿病或多发性硬化等疾病、脊髓损伤、手术造成的伤害或心理问题等。
6.不明原因
当医生不能确诊男性不育的原因时，诊断结果可能是原因不明。有些专家认为，环境毒素可能是影响因素，但还没有确定两者有直接的关联。