长期大量食用花椒可能对健康产生不利影响，主要涉及胃肠刺激、口腔黏膜损伤、体质偏热加重、特殊人群风险、营养失衡等方面。花椒含有挥发油和生物碱类物质，过量摄入可能引发身体不适。
花椒中的花椒素和柠檬烯等成分会刺激胃肠黏膜，空腹或过量食用易引发胃痛、反酸、腹泻等症状。胃肠功能较弱者可能出现持续性腹部隐痛，长期如此可能增加胃炎或胃溃疡风险。建议与主食搭配食用，单日摄入量控制在5克以内。
花椒的麻味来源于羟基山椒素，这种神经刺激物质可能造成口腔黏膜麻木、灼热感。频繁食用会导致味觉敏感度下降，部分人群可能出现口腔溃疡反复发作。食用后建议用淡盐水漱口，避免连续多日高频次摄入。
中医理论认为花椒性温燥，阴虚火旺体质者长期食用可能加重口干舌燥、便秘痤疮等症状。更年期女性或易上火人群可能出现夜间盗汗、咽喉肿痛等不适。可搭配菊花、金银花等凉性食材中和燥性。
孕妇过量摄入可能刺激子宫平滑肌，孕早期需谨慎。哺乳期女性食用后可能通过乳汁影响婴儿消化功能。术后患者食用可能延缓伤口愈合，高血压患者需注意花椒粉中的钠含量。此类人群建议咨询医师后控制用量。
过度依赖花椒调味可能掩盖食材本味，导致盐分和油脂摄入超标。长期单一使用可能影响膳食多样性，造成维生素B族和膳食纤维摄入不足。建议交替使用葱姜蒜等天然香料，保持饮食均衡。
日常饮食中可将花椒作为辅助调味品，使用前短暂煸炒能降低刺激性。阴虚体质者可选择花椒油替代干花椒，减少燥热之性。搭配白萝卜、莲藕等凉性食材可中和温燥特性，食用后适当增加水分补充。出现持续胃部不适或口腔炎症时应暂停食用，必要时就医检查。特殊人群使用前建议进行中医体质辨识，制定个性化饮食方案。