感染性的龟头炎常由于不洁房事，感染了白色念珠菌、滴虫、衣原体、支原体、淋病双球菌或其他细菌引起；非感染因素多是由于包皮过长，清洁不够，包皮和龟头之间的不洁之物，即包皮垢，便会堆积起来，刺激局部的包皮和粘膜发生炎症。
龟头炎治疗方法是要针对发炎的原因，因此会因人而异。医生会因应个别患者的病情、其对生活的影响及患者身体是否有其它疾病，而建议最恰当龟头炎治疗方法。
西医在龟头炎治疗上的基本原则是消炎杀菌。一般是内外并治。治疗方案主要有以下几种：
(1)保持局部清洁，避免刺激。
(2)局部治疗很重要，干燥脱屑为主者，涂皮质类固醇油膏。糜烂渗液为主者，用高锰酸钾溶液或雷弗奴尔-间苯二酚溶液湿敷。溃疡面每日换药，并作物理治疗。
(3)感染明显伴有发热和淋巴结肿大者，可全身应用抗生素。
(4)凡病因明确者应针对致病因素进行特殊处理。如念珠菌性包皮龟头炎局部应用制霉菌素或酉同康唑。阿米巴性包皮龟头炎给予依米丁注射。滴虫性包皮龟头炎可给予甲硝唑或替硝唑。
(5)包皮过长者，待急性炎症控制后进行包皮环切术。
中医在龟头炎治疗方面常把其分为三型，即毒火郁结型、湿热生虫型和肝肾阴亏型三种。根据不同的临床表现予以不同的龟头炎治疗方法。