据统计，生理期避孕的成功率约有70%～80%。因为女性卵巢排卵的周期是受激素调节的，而激素的分泌容易受到多种因素的影响。
外界因素 如外出旅行、环境改变、气候变化、事件的发生等等，都可能对人体造成一定的刺激，影响激素分泌，从而导致排卵的提前或推迟。
自身因素 疾病、精神紧张、本人的情绪兴奋或压抑等，都可能使月经周期缩短或延长。另外，性行为也会刺激排卵。因为女性在高度兴奋时体内的激素水平会发生奇妙的改变，当有精子的信号进入，可能会刺激卵巢分泌出一个“额外”的卵子，让精子能够找到结合的目标。
计算方法 除此之外，如果排卵日期推算不准确或者测试排卵方法没有掌握的，也很容易导致避孕失败。目前用于测定排卵期的方法有日历法、基础体温测量法和宫颈黏液观察法，这三种方法各有其优缺点，最好是三者合起来使用，且需经过正确的培训。