阳萎的内分泌治疗有一定效果，但主要应用于真正激素缺乏的患者。如继发于低促性腺激素性腺功能减退症的阳萎，用绒毛膜促性腺激素或睾丸酮均有效，特殊情况还可选用促性腺激素释放激素（GnRH）。临床常选用如下药物治疗：
（l）丙酸睾丸酮25毫克，隔日肌内注射，连用5——7次。不可久用。
（2）绒毛膜促性腺激素500——1000单位，每3日肌内注射1次，连用3——4周。有利于射精，但有心悸之副作用。
（3）醋酸生育酚200毫克，每日3次，口服。
（4）对精神性阳萎患者给予男性激素治疗，有时也可增强其勃起能力，但往往会使性欲增强明显，而房事能力提高不大，反而造成焦虑，应引起注意。精神性阳萎可用小剂量安定类药物、维生素B族、维生素E，还有中成药鹿茸精、金匾肾气九、六味地黄九、五子衍宗丸等。
运用内分泌治疗阳萎时，要掌握疗程，不可使用剂量过大或时间过长，以免扰乱正常机体的激素分泌。