女性避孕对身体危害最小的方法是以生理调控为主的避孕方式，如使用避孕套或计算安全期，同时结合自身情况选择适合的工具与避孕手段。每种避孕方式对身体的影响不同，需根据自身需求及身体状态综合考量。
1、避孕套：既安全又无副作用
避孕套是使用最广泛且对女性身体伤害最小的避孕方式之一。避孕套通过物理隔离精子与卵子接触避免怀孕，不涉及激素干预，对内分泌系统无影响。避孕套还能有效预防性传播疾病如艾滋病和梅毒，是健康无副作用的首选方式。但是，需要注意避孕套的使用正确性，确保每次都有正确佩戴和选择适合的尺寸，避免脱落或破裂。
2、安全期避孕：适合月经规律的女性
安全期避孕通过观察月经周期并计算可能的排卵日期来避免同房。由于不借助药物或其他工具，安全期避孕对身体完全无伤害。但这一方法对月经周期特别稳定的女性更适用，若月经不规律，排卵期难以准确预测，则避孕失败率较高。可以借助基础体温测量或者排卵试纸辅助计算，提高安全系数。
3、短效避孕药：正确使用伤害较低
短效口服避孕药通过人工合成激素来抑制排卵，同时改变宫颈黏液性质，阻止精子进入子宫。虽然短效避孕药对部分女性会带来副作用如恶心、头痛、乳腺胀痛，但总体上是较为安全且高效的方式。需要在医生指导下选用适合自己体质的药物，按时服用，避免随意停药或漏服，以减少身体的负担。
4、宫内节育器避孕环：高效低风险
宫内节育器通过改变子宫内环境，阻止受精卵着床从而达到避孕效果。这种方式避孕效果长期稳定，其对健康女性的影响较小，尤其适合已经生育过的女性。但是，节育环可能带来少量月经增多或下腹坠痛的不适感，初次尝试或生育需求未完全结束的女性需慎选。
对于需要避孕的女性来说，科学避孕需要关注身体健康状态和生活习惯。避孕套、安全期避孕和短效口服避孕药对身体损害较小，但每种方法都有其适用范围。建议根据自身情况选择适合的方式，必要时咨询专业医生以确保科学安全。