支原体前列腺炎的治疗，通常以药物治疗为主。在临床上对于支原体感染引起的慢性非细菌性炎症，可遵医嘱使用大环内酯类抗生素、喹诺酮类抗生素等进行抗感染治疗；同时还可以配合医生采取物理疗法和调整生活方式的方法来辅助治疗。
一、药物治疗
1.大环内酯类抗生素：如阿奇霉素、罗红霉素、克拉霉素等，对支原体敏感度较高，可以抑制病菌生长繁殖，并且不会导致正常细菌灭活，因此属于临床首选的抗菌药。但在用药期间不能饮酒，以免引起双硫仑样反应，出现恶心、呕吐等症状。
2.喹诺酮类抗生素：如果患者年龄超过18周岁，而且没有禁忌证的情况下，也可以遵医嘱服用左氧氟沙星或盐酸莫西沙星片等药物进行治疗。此类药物不仅具有广谱杀菌作用，还能够抑制蛋白质合成，从而达到抑菌效果。
二、物理疗法
常见的有微波理疗以及热水坐浴等方法，通过促进血液循环，加速新陈代谢，有利于炎症消退。
三、调整生活方式
日常生活中应避免憋尿、久坐，适当运动锻炼身体，注意饮食清淡，保持规律作息时间，保证充足的睡眠，戒烟酒等不良习惯，都有助于改善症状。
部分患者还可选择中药方剂来进行调理，比如用八正散加减或者四妙丸合萆薢分清饮加减等，也有利于缓解不适症状。