慢性前列腺炎是发病率较高且让人十分困惑的疾病，由于其病因、病理改变，临床症状复杂多样，多数治疗方法的效果不理想，又由于社会上大量不实宣传及许多医疗机构的不正规诊疗和误诊误治，导致许多慢性前列腺疾病久治不愈，严重地影响了患者的生活质量，给他们的精神和肉体造成极大伤害。
1、前列腺的比邻关系复杂：前列腺上邻膀胱，后邻直肠，外上方是精囊和输精管壶腹，中有尿道和射精管穿过，些器官病变及前列腺病变均可相互影响。前列腺是腺性分泌器官，前列腺外因区腺管垂直角或斜行进入后尿道，路径长且开口较小，容易受很多因素影响而排泌不畅，造成前列腺液的潴留，并容易诱发感染。
2、前列腺的组织结构改变：慢性前列腺炎可导致前列腺体内血管闭塞、腺体实质的纤维化与疤痕形成、腺体萎缩变硬或水肿，甚至钙化及结石形成，使药物治疗很难在前列腺内达到有效的药物浓度，病原体可以在局部大量繁殖和扩散，进一步加重了局部炎症反应、腺管闭塞范围和纤维化程度。
3、前列腺炎的病因复杂多样：除细菌感染外，自身免疫反应或免疫异常、盆底精神肌肉紧张、前列腺内的尿液返流、物理损伤、前列腺结石、炎症、长期充血、尿酸异常、尿道狭窄、精睾肥大、前列腺增生、食物过敏、真菌或病毒感染等也是造成前列腺疼痛和炎症反应的重要因素，前列腺周围组织器官，肌肉和神经功能障碍也可能导致前列腺炎的病理改变。
4、不良生活习惯的持续存在：许多前列腺炎患者的发病就是因为在生活中存在许多不良的习惯，如生活中不讲究卫生，有不洁性生活史、频繁性交或手淫、酗酒或大量食用刺激性食物，长距离骑车或久坐、局部不注意保暖等多种因素均可造成患者前列腺长期充血，诱发慢性前列腺疾病，并最终使其久治不愈。而且这些患者患病后及治疗期间，不良生活习惯可能仍然存在。
5、精神心理因素和消极的应对方式：慢性前列腺疾病患者可有失眠、健忘、焦虑、抑郁，甚至胡思乱想乃至悲观失望等情绪，这方面的困惑有时甚至超过疾病本身的痛苦，导致有的四处乱投医，有的则自暴自弃，成为慢性前列腺疾病难治的原因之一。
6、医患关系复杂：社会办医较多，鱼龙混杂情况严重，医疗广告泛滥，游医也大量存在，有意无意的误诊、误治难免存在。一些大医院的泌尿科医生缺乏系统培训，缺乏有效的治疗手段，使许多患者误认为前列腺是根本治不好的病，影响了慢性前列腺疾病的系统诊断和规范治疗。另外，大量地使用抗生素及滥用其他药物，破坏了患者的机体免疫使得患者病情进一步加重。